Sobre la fundación de Seyé “Escalera pequeña” no hay datos exactos, aunque existe desde antes de la conquista. En la época prehispánica perteneció al cacicazgo de Hocabail-Homún. Durante la colonia, bajo el régimen de encomienda estuvo a cargo de Alonso de Rojas (1579); Joaquín Gómez (1607); Antonio Gómez Pacheco (1647) y Pablo de Aguilar (1688).

Está localizado en la región centro del Estado. Queda comprendido entre los paralelos 20° 48' y 20° 58' latitud norte y los meridianos 89° 17' y 89° 24' longitud oeste; posee una altura promedio de 14 metros sobre el nivel del mar. 

Extensión

El municipio de Seyé ocupa una superficie de 186.50 Km2. Limita al norte con  Tixkokob, al sur con Cuzama , al este con Homun-Hocaba-Tahmek, al oeste con  Tixpéual-Acanceh.

Orografía

La superficie es plana, con llanura de barrera,  con piso rocoso o cementado, alta y escarpada. 

Hidrografía

En el territorio municipal no existen corrientes superficiales de agua. Sin embargo, hay corrientes subterráneas que forman depósitos comúnmente conocidos como cenotes. En alguno casos los techos de estos se desploman y forman las aguadas:

Clima

La región está clasificada como cálida-subhúmeda,  con lluvias en verano, que al interrumpirse forman las llamadas sequías de medio verano. Temperatura media anual de 25.5º C y precipitación pluvial media de 72.3 milímetros.  Predominan los vientos procedentes del sureste .

Principales Ecosistemas

Flora

Existen pequeñas porciones de selva baja caducifolia con vegetación secundaria en los extremos sur y noroeste del municipio. Algunas especies comunes son: chechén, bonete, amapola, chaya y flamboyán. 

Fauna